Για όσο διάστημα κατανοούμε τους μηχανισμούς της ζωής, ο αριθμός είκοσι αποτελεί μια θεμελιώδη σταθερά. Κάθε ζωντανός οργανισμός στη Γη, από τη μούχλα στο ψωμί σας μέχρι τον άνθρωπο που κάθεται δίπλα σας, δομείται χρησιμοποιώντας ένα τυπικό σύνολο 20 αμινοξέων. Σκεφτείτε τα ως το βιολογικό ισοδύναμο των τούβλων Lego. Παρόλο που μπορούν να συναρμολογηθούν σε μια άπειρη ποικιλία πρωτεϊνών, τα σχήματα των ίδιων των τούβλων δεν έχουν αλλάξει εδώ και δισεκατομμύρια χρόνια. Υποθέταμε επί μακρόν ότι αυτό το σύνολο των είκοσι ήταν το βελτιστοποιημένο, τέλειο αποτέλεσμα της εξέλιξης—μια αμετάβλητη βάση για τη ζωή.
Ωστόσο, ένα πρωτοποριακό κίνημα στη συνθετική βιολογία αμφισβητεί τώρα αυτό το αφήγημα. Ενώ η εκλαϊκευμένη επιστήμη συχνά επικεντρώνεται στην προσθήκη νέων χαρακτηριστικών στη ζωή—όπως φυτά που φωσφορίζουν ή καλλιέργειες εμπλουτισμένες με βιταμίνες—μια ομάδα ερευνητών ακολουθεί μια αντίθετη προσέγγιση. Δεν προσπαθούν να προσθέσουν στην εργαλειοθήκη· προσπαθούν να δουν πόσο μέρος της μπορούν να πετάξουν. Μέσω της επιτυχούς δημιουργίας οργανισμών που λειτουργούν με μόνο 19 αμινοξέα, αυτοί οι επιστήμονες αποδεικνύουν ότι ο «τέλειος» αριθμός της φύσης μπορεί στην πραγματικότητα να είναι λίγο διογκωμένος.
Κοιτάζοντας τη συνολική εικόνα, αυτό δεν είναι απλώς ένα περίεργο εργαστηριακό τέχνασμα. Πρόκειται για μια θεμελιώδη αλλαγή στον τρόπο με τον οποίο προσεγγίζουμε τη βιομηχανοποίηση της βιολογίας. Για να καταλάβουμε γιατί κάποιος θα ήθελε να κάνει τη ζωή πιο περιορισμένη, πρέπει να κοιτάξουμε «κάτω από το καπό» στο πώς κατασκευάζονται πραγματικά οι πρωτεΐνες.
Για να κατανοήσουμε τι συμβαίνει εδώ, βοηθά να δούμε τον γενετικό κώδικα ως ένα λειτουργικό σύστημα. Σε αυτό το λειτουργικό σύστημα (OS), το DNA σας παρέχει τις οδηγίες και τα αμινοξέα είναι τα φυσικά υλικά που χρησιμοποιούνται για την εκτέλεση αυτών των οδηγιών. Κάθε πρωτεΐνη στο σώμα σας είναι μια μακριά αλυσίδα από αυτά τα 20 αμινοξέα, αναδιπλωμένη σε ένα συγκεκριμένο σχήμα για να εκτελέσει μια εργασία—για παράδειγμα, τη μεταφορά οξυγόνου στο αίμα σας ή την πέψη του μεσημεριανού σας γεύματος.
Κάθε τρία γράμματα του DNA (που ονομάζονται κωδικόνια) λειτουργούν ως εντολή για την «εισαγωγή του αμινοξέος Χ εδώ». Επειδή υπάρχουν 64 πιθανοί συνδυασμοί γραμμάτων DNA αλλά μόνο 20 αμινοξέα, το σύστημα έχει μεγάλη πλεονασματικότητα. Είναι λίγο σαν να έχεις πέντε διαφορετικούς τρόπους για να πεις τη λέξη «μπλε» σε ένα εγχειρίδιο. Για δισεκατομμύρια χρόνια, η ζωή απλώς αντιμετώπιζε αυτή την αναποτελεσματικότητα.
Με απλά λόγια, οι ερευνητές εξετάζουν τώρα αυτό το εγχειρίδιο και διαγράφουν μία από τις λέξεις. Παίρνουν ένα συγκεκριμένο αμινοξύ—για παράδειγμα, τη σερίνη ή τη λευκίνη—και επανασχεδιάζουν τον μηχανισμό του κυττάρου έτσι ώστε να μην αναγνωρίζει πλέον το συγκεκριμένο τούβλο. Στη συνέχεια, αντικαθιστούν κάθε εμφάνιση αυτού του «διαγραμμένου» τούβλου με ένα παρόμοιο από τα υπόλοιπα 19. Ουσιαστικά, απλοποιούν τον πηγαίο κώδικα της ζωής για να τρέχει σε ένα πιο περιορισμένο σύνολο υλικού (hardware).
Γιατί να μπει κανείς στον τεράστιο κόπο να ξαναγράψει ένα γονιδίωμα για να χρησιμοποιήσει λιγότερα μέρη; Η απάντηση βρίσκεται στην ασφάλεια και τη βιομηχανική ανθεκτικότητα. Επί του παρόντος, τα πιο σημαντικά φάρμακά μας—όπως η ινσουλίνη και ορισμένες θεραπείες για τον καρκίνο—παρασκευάζονται σε γιγάντιες δεξαμενές βακτηρίων ή ζυμομυκήτων. Αυτά τα μικροσκοπικά εργοστάσια είναι εξαιρετικά αποδοτικά, αλλά έχουν μια τεράστια ευπάθεια: μιλούν την ίδια γλώσσα με τον υπόλοιπο κόσμο.
Εάν ένας ιός εισέλθει σε έναν παραδοσιακό βιοαντιδραστήρα, μπορεί να καταλάβει τα βακτήρια επειδή τόσο ο ιός όσο και τα βακτήρια χρησιμοποιούν τα ίδια 20 αμινοξέα. Ο ιός χρησιμοποιεί τους «3D εκτυπωτές» των ίδιων των βακτηρίων για να αναπαραχθεί, καταστρέφοντας την παρτίδα και κοστίζοντας στις εταιρείες εκατομμύρια δολάρια.
Περικόπτοντας τον κώδικα στα 19 αμινοξέα, οι επιστήμονες δημιουργούν αυτό που ονομάζουν γενετικό τείχος προστασίας (firewall). Ένας οργανισμός με 19 αμινοξέα μιλά ουσιαστικά μια διάλεκτο που κανένας φυσικός ιός δεν μπορεί να καταλάβει. Εάν ένας ιός εισέλθει σε ένα κύτταρο «19 αμινοξέων» και απαιτήσει να χρησιμοποιήσει το 20ό τούβλο για να φτιάξει μια ιογενή πρωτεΐνη, το κύτταρο απλώς δεν μπορεί να το κάνει. Οι οδηγίες γίνονται ακαταλαβίστικες. Αυτό δημιουργεί ένα ισχυρό, αποκεντρωμένο σύστημα άμυνας που θα μπορούσε να καταστήσει την παραγωγή σωτήριων φαρμάκων πολύ φθηνότερη και πιο αξιόπιστη.
Για τον μέσο χρήστη, η ιδέα ενός βακτηρίου με 19 αμινοξέα μπορεί να μοιάζει με μια μακρινή ακαδημαϊκή αναζήτηση. Πρακτικά, ωστόσο, αυτή η τεχνολογία αποτελεί τη βάση για μια πιο ανθεκτική αλυσίδα εφοδιασμού στις βιομηχανίες φαρμάκων και υλικών.
Σκεφτείτε την αστάθεια των τιμών των φαρμάκων. Ένα σημαντικό μέρος του κόστους των βιολογικών φαρμάκων προέρχεται από τα ακραία μέτρα που λαμβάνονται για να διατηρηθούν τα περιβάλλοντα παραγωγής αποστειρωμένα και ελεύθερα από ιούς. Εάν μπορούμε να προχωρήσουμε προς «εγγενώς ασφαλείς» οργανισμούς που είναι απρόσβλητοι από φυσική μόλυνση εκ σχεδιασμού, αλλάζουμε τα οικονομικά της ιατρικής. Προσβλέπουμε σε ένα μέλλον όπου το «υλικό» της ζωής θα είναι λιγότερο εύθραυστο.
Επιπλέον, αυτή η έρευνα ανοίγει την πόρτα σε πραγματικά συνθετικά υλικά. Μόλις αποκτήσετε ένα κύτταρο που αγνοεί ένα από τα τυπικά 20 αμινοξέα, μπορείτε να «επαναπροσδιορίσετε» αυτή την κενή θέση σε ένα συνθετικό, ανθρωπογενές αμινοξύ. Αυτό μας επιτρέπει να δημιουργήσουμε πρωτεΐνες με ιδιότητες που δεν υπάρχουν στη φύση—σκεφτείτε ίνες τόσο ισχυρές όσο το μετάξι της αράχνης αλλά τόσο εύκαμπτες όσο το καουτσούκ, ή ένζυμα που μπορούν να διασπάσουν τα πλαστικά στους ωκεανούς χωρίς να αποδομηθούν τα ίδια.
Φυσικά, όποτε επεμβαίνουμε στη θεμελιώδη λογική της βιολογίας, ένας βαθμός σκεπτικισμού είναι υγιής. Οι επικριτές της συνθετικής βιολογίας συχνά επισημαίνουν τον κίνδυνο «ακούσιων συνεπειών». Εάν δημιουργήσουμε έναν οργανισμό που είναι απρόσβλητος σε όλους τους γνωστούς ιούς, τι συμβαίνει εάν δραπετεύσει από το εργαστήριο;
Περιέργως, η προσέγγιση των 19 αμινοξέων προσφέρει στην πραγματικότητα έναν ενσωματωμένο μηχανισμό ασφαλείας. Αυτοί οι τροποποιημένοι οργανισμοί είναι συχνά σχεδιασμένοι να είναι «αυξότροφοι», που σημαίνει ότι είναι εθισμένοι σε μια συγκεκριμένη συνθετική χημική ουσία που δεν υπάρχει στη φύση. Εάν εγκαταλείψουν το ελεγχόμενο περιβάλλον του εργαστηρίου ή του εργοστασίου, απλώς σταματούν να λειτουργούν. Σε αντίθεση με τους παραδοσιακούς ΓΤΟ (GMOs), οι οποίοι είναι απλώς ελαφρώς τροποποιημένες εκδοχές φυσικών φυτών, αυτοί οι οργανισμοί μειωμένου κώδικα είναι τόσο θεμελιωδώς διαφορετικοί που είναι βιολογικά απομονωμένοι από το υπόλοιπο οικοσύστημα του πλανήτη.
Κοιτάζοντας την πλευρά της αγοράς, βλέπουμε μια μετατόπιση στη ροή των επιχειρηματικών κεφαλαίων. Η προηγούμενη δεκαετία αφορούσε την «ανάγνωση» του DNA (γονιδιωματική) και την «επεξεργασία» του DNA (CRISPR). Η επόμενη δεκαετία αφορά όλο και περισσότερο τη «συγγραφή» εντελώς νέων συστημάτων.
Ιστορικά, η βαριά βιομηχανία βασιζόταν στη χημεία και τη θερμότητα για να οικοδομήσει τον κόσμο. Σήμερα, βλέπουμε τη βιολογία να αναδύεται ως η αόρατη ραχοκοκαλιά της σύγχρονης παραγωγής. Είτε πρόκειται για την παρασκευή καυσίμων αεριωθούμενων από φύκια είτε για την καλλιέργεια δέρματος σε εργαστήριο, ο στόχος είναι να γίνουν αυτές οι διαδικασίες τόσο προβλέψιμες και κλιμακώσιμες όσο μια ενημέρωση λογισμικού. Η μείωση της πολυπλοκότητας του γενετικού κώδικα είναι ένα ανατρεπτικό βήμα προς τη μετατροπή της βιολογίας σε μια πραγματική μηχανική επιστήμη και όχι σε μια σειρά από τυχαία γεγονότα.
| Χαρακτηριστικό | Τυπική Βιολογία (20 Αμινοξέα) | Απλοποιημένη Βιολογία (19 Αμινοξέα) |
|---|---|---|
| Αντοχή σε Ιούς | Ευάλωτη σε φυσικούς ιούς | Φυσική ανοσία στους περισσότερους ιούς |
| Ασφάλεια/Περιορισμός | Συχνά μπορεί να διασταυρωθεί με άγρια είδη | Βιολογικά απομονωμένη/Γενετικό firewall |
| Βιομηχανική Χρήση | Υψηλό κόστος αποστείρωσης | Δυνατότητα για βιοεπεξεργασία σε «ανοιχτό αέρα» |
| Ποικιλία Υλικών | Περιορίζεται σε φυσικές πρωτεΐνες | Μπορεί να ενσωματώσει συνθετικά δομικά στοιχεία |
| Πολυπλοκότητα | Υψηλή (εξελικτικός «κώδικας σπαγγέτι») | Μειωμένη (σχεδιασμένη για αποδοτικότητα) |
Τελικά, αυτή η έρευνα υποδηλώνει ότι οι περιορισμοί της φύσης δεν είναι τόσο άκαμπτοι όσο νομίζαμε κάποτε. Αφαιρώντας ένα μικρό κομμάτι του γενετικού παζλ, δεν κάνουμε τη ζωή απλώς απλούστερη· την κάνουμε πιο ελεγχόμενη, πιο ανθεκτική και πιο χρήσιμη για έναν σύγχρονο βιομηχανικό κόσμο. Ως καταναλωτής, μπορεί να μην δείτε ποτέ ένα κύτταρο 19 αμινοξέων, αλλά σχεδόν σίγουρα θα χρησιμοποιήσετε τα προϊόντα που δημιουργούν. Είναι καιρός να αλλάξουμε την προοπτική μας: μερικές φορές, για να προχωρήσουμε μπροστά, πρέπει να αφήσουμε πίσω μας ένα κομμάτι του παρελθόντος.
Πηγές:



Η από άκρη σε άκρη κρυπτογραφημένη λύση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου και αποθήκευσης στο cloud παρέχει τα πιο ισχυρά μέσα ασφαλούς ανταλλαγής δεδομένων, εξασφαλίζοντας την ασφάλεια και το απόρρητο των δεδομένων σας.
/ Εγγραφείτε δωρεάν