Nii kaua kui oleme mõistnud elu mehaanikat, on arv kakskümmend olnud fundamentaalne konstant. Iga elusolend Maal, alates hallitusest teie leival kuni teiega külg külje kõrval istuva inimeseni, ehitab end üles kasutades standardset 20 aminohappe komplekti. Mõelge neist kui bioloogilistest Lego klotsidest. Kuigi neid saab kokku panna lõpmatu hulga erinevateks valkudeks, pole klotside endi kuju miljardite aastate jooksul muutunud. Oleme kaua eeldanud, et see kahekümnest koosnev komplekt on evolutsiooni optimeeritud ja täiuslik tulemus — muumatu alustala elule.
Kuid murranguline liikumine sünteetilises bioloogias esitab nüüd sellele narratiivile väljakutse. Kui populaarteadus keskendub sageli elule uute funktsioonide lisamisele — nagu helendavad taimed või vitamiinidega rikastatud põllukultuurid —, siis rühm teadlasi on valinud vastupidise lähenemisviisi. Nad ei püüa tööriistakasti täiendada, vaid uurivad, kui palju sellest saab ära visata. Luues edukalt organisme, mis toimivad vaid 19 aminohappega, tõestavad need teadlased, et looduse "täiuslik" arv võib tegelikult olla veidi ülepaisutatud.
Suurt pilti vaadates pole see lihtsalt kummaline laboritrikk. See on fundamentaalne muutus selles, kuidas me läheneme bioloogia industrialiseerimisele. Mõistmaks, miks keegi tahaks elu piiratumaks muuta, peame vaatama "kapoti alla", kuidas valke tegelikult ehitatakse.
Selleks, et mõista siin toimuvat, aitab geneetilise koodi vaatlemine operatsioonisüsteemina. Selles OS-is annab teie DNA juhised ja aminohapped on füüsilised materjalid, mida kasutatakse nende juhiste täitmiseks. Iga valk teie kehas on nende 20 aminohappe pikk ahel, mis on volditud kindlasse kujusse, et täita ülesannet — näiteks hapniku kandmine veres või lõunasöögi seedimine.
Iga kolm DNA tähte (mida nimetatakse koodoniks) toimib käsklusega "sisesta siia aminohape X". Kuna DNA tähtedest on 64 võimalikku kombinatsiooni, kuid ainult 20 aminohapet, on süsteemis palju korduvust. See on veidi nagu viis erinevat viisi sõna "sinine" ütlemiseks kasutusjuhendis. Miljardeid aastaid on elu selle ebatõhususega lihtsalt toime tulnud.
Lihtsamalt öeldes käivad teadlased nüüd seda kasutusjuhendit läbi ja kustutavad ühe sõnadest. Nad võtavad konkreetse aminohappe — näiteks seriini või leutsiini — ja konstrueerivad raku masinavärgi ümber nii, et see ei tunneks enam seda konkreetset klotsi ära. Seejärel asendavad nad selle "kustutatud" klotsi iga esinemise sarnasega ülejäänud 19 hulgast. Sisuliselt voolujoonestavad nad elu lähtekoodi, et see töötaks piiratumal riistvaral.
Miks näha nii suurt vaeva genoomi ümberkirjutamisega, et kasutada vähem osi? Vastus peitub turvalisuses ja tööstuslikus vastupidavuses. Praegu toodetakse meie kõige olulisemaid ravimeid — nagu insuliini ja teatud vähiravimeid — hiiglaslikes bakterite või pärmseente mahutites. Need mikroskoopilised tehased on väga tõhusad, kuid neil on massiivne haavatavus: nad räägivad sama keelt kui ülejäänud maailm.
Kui viirus siseneb traditsioonilisse bioreaktorisse, saab see bakterid kaaperdada, sest nii viirus kui ka bakter kasutavad samu 20 aminohapet. Viirus kasutab bakteri enda "3D-printereid", et end paljundada, hävitades partii ja läheb ettevõtetele maksma miljoneid dollareid.
Kärpides koodi 19 aminohappeni, loovad teadlased seda, mida nad nimetavad geneetiliseks tulemüüriks. 19 aminohappega organism räägib sisuliselt murret, mida ükski looduslik viirus ei mõista. Kui viirus siseneb "19-happe" rakku ja nõuab, et see kasutaks viirusvalgu ehitamiseks 20. klotsi, siis rakk lihtsalt ei suuda seda teha. Juhised muutuvad loetamatuks jamaks. See loob jõulise, detsentraliseeritud kaitsesüsteemi, mis võib muuta elupäästvate ravimite tootmise palju odavamaks ja usaldusväärsemaks.
Tavakasutaja jaoks võib idee 19 aminohappega bakterist tunduda kaugelasuva akadeemilise püüdlusena. Praktiliselt võttes on see tehnoloogia aga aluseks vastupidavamale tarneahelale farmaatsia- ja materjalitööstuses.
Mõelge ravimihindade volatiilsusele. Oluline osa bioloogiliste ravimite maksumusest tuleneb äärmuslikest meetmetest, mida rakendatakse tootmiskeskkondade steriilsuse ja viirusvabaduse tagamiseks. Kui saame liikuda "olemuslikult ohutute" organismide poole, mis on loodusliku saastumise suhtes immuunsed juba disaini poolest, muudame meditsiiniökonoomikat. Me vaatame tulevikku, kus elu riistvara on vähem habras.
Lisaks avab see uurimistöö ukse tõeliselt sünteetilistele materjalidele. Kui teil on rakk, mis ignoreerib ühte standardsetest 20 aminohappest, saate selle tühja koha "ümber määrata" sünteetilisele, inimese loodud aminohappele. See võimaldab meil luua valke omadustega, mida looduses ei eksisteeri — mõelge kiududele, mis on tugevad nagu ämblikuvõrk, kuid paindlikud nagu kumm, või ensüümidele, mis suudavad ookeanis plasti lagundada, ilma et nad ise laguneksid.
Loomulikult on bioloogia fundamentaalse loogika kallal nokitsemisel teatav skeptitsism tervislik. Sünteetilise bioloogia kriitikud viitavad sageli "ettenägematute tagajärgede" riskile. Kui loome organismi, mis on immuunne kõigile teadaolevatele viirustele, siis mis saab, kui see laborist põgeneb?
Huvitaval kombel pakub 19 aminohappe lähenemine tegelikult sisseehitatud ohutusmehhanismi. Need muundatud organismid on sageli kavandatud "auksotroofseteks", mis tähendab, et nad on sõltuvuses konkreetsest sünteetilisest kemikaalist, mida looduses ei eksisteeri. Kui nad lahkuvad labori või tehase kontrollitud keskkonnast, lõpetavad nad lihtsalt toimimise. Erinevalt traditsioonilistest GMO-dest, mis on vaid veidi muudetud versioonid looduslikest taimedest, on need vähendatud koodiga organismid nii fundamentaalselt erinevad, et nad on ülejäänud planeedi ökosüsteemist bioloogiliselt isoleeritud.
Turu poolt vaadates näeme nihet selles, kuhu voolab riskikapital. Eelmine kümnend oli DNA "lugemise" (genoomika) ja DNA "toimetamise" (CRISPR) päralt. Järgmine kümnend on üha enam täiesti uute süsteemide "kirjutamise" päralt.
Ajalooliselt tugines rasketööstus maailma ehitamisel keemiale ja kuumusele. Täna näeme bioloogia esilekerkimist kaasaegse tootmise nähtamatu selgroona. Olgu selleks siis vetikatest lennukikütuse pruulimine või laboris naha kasvatamine, eesmärk on muuta need protsessid sama ennustatavaks ja skaleeritavaks kui tarkvarauuendus. Geneetilise koodi keerukuse vähendamine on murranguline samm selle suunas, et muuta bioloogia tõeliseks inseneriteaduseks, mitte rea õnnelikeks juhusteks.
| Funktsioon | Standardne bioloogia (20 aminohapet) | Voolujooneline bioloogia (19 aminohapet) |
|---|---|---|
| Viirusresistentsus | Haavatav looduslikele viirustele | Loomulikult immuunne enamikule viirustele |
| Ohutus/Ohjeldamine | Võib sageli ristuda metsikute liikidega | Bioloogiliselt isoleeritud/Geneetiline tulemüür |
| Tööstuslik kasutus | Kõrged steriilsuskulud | Potentsiaal "vabaõhu" biotöötluseks |
| Materjalide mitmekesisus | Piiratud looduslike valkudega | Võib sisaldada sünteetilisi ehitusplokke |
| Keerukus | Kõrge (evolutsiooniline "spagetikood") | Vähendatud (projekteeritud tõhususe saavutamiseks) |
Lõppkokkuvõttes viitab see uurimistöö sellele, et looduse piirangud ei ole nii jäigad, kui me kunagi arvasime. Eemaldades ühe väikese osa geneetilisest puslest, ei muuda me elu lihtsalt lihtsamaks; me muudame selle kontrollitavamaks, vastupidavamaks ja kasulikumaks kaasaegse tööstusmaailma jaoks. Tarbijana ei pruugi te kunagi näha 19 aminohappega rakku, kuid te hakkate peaaegu kindlasti kasutama tooteid, mida need loovad. On aeg muuta oma perspektiivi: mõnikord peame edasiliikumiseks jätma osa minevikust seljataha.
Allikad:



Meie läbivalt krüpteeritud e-posti ja pilvesalvestuse lahendus pakub kõige võimsamaid vahendeid turvaliseks andmevahetuseks, tagades teie andmete turvalisuse ja privaatsuse.
/ Tasuta konto loomin