Kopš mēs izprotam dzīvības mehāniku, skaitlis divdesmit ir bijusi fundamentāla konstante. Katra dzīvā būtne uz Zemes, sākot no pelējuma uz jūsu maizes un beidzot ar cilvēku, kas sēž jums blakus, veido sevi, izmantojot standarta 20 aminoskābju komplektu. Domājiet par tām kā par bioloģisko ekvivalentu Lego klučiem. Lai gan tos var salikt bezgalīgi daudzos proteīnu veidos, pašu kluču formas nav mainījušās miljardiem gadu. Mēs ilgi esam pieņēmuši, ka šis divdesmitnieks ir optimizēts, ideāls evolūcijas rezultāts — nemainīgs dzīvības pamats.
Tomēr revolucionāra kustība sintētiskajā bioloģijā tagad apstrīd šo naratīvu. Kamēr populārzinātnē bieži vien uzmanība tiek pievērsta jaunu funkciju pievienošanai dzīvībai — piemēram, spīdošiem augiem vai ar vitamīniem bagātinātām kultūrām —, pētnieku grupa izmanto pretēju pieeju. Viņi nemēģina papildināt rīku komplektu; viņi mēģina noskaidrot, cik daudz no tā var izmest. Veiksmīgi izveidojot organismus, kas funkcionē tikai ar 19 aminoskābēm, šie zinātnieki pierāda, ka dabas "ideālais" skaitlis patiesībā varētu būt nedaudz uzpūsts.
Raugoties uz kopējo ainu, tas nav tikai dīvains laboratorijas triks. Tā ir fundamentāla maiņa tajā, kā mēs pieejam bioloģijas industrializācijai. Lai saprastu, kāpēc kāds vēlētos padarīt dzīvību ierobežotāku, mums ir jāieskatās "zem pārsega", kā proteīni patiesībā tiek veidoti.
Lai saprastu, kas šeit notiek, palīdz ģenētiskā koda uzlūkošana kā operētājsistēma. Šajā OS jūsu DNS sniedz instrukcijas, un aminoskābes ir fiziskie materiāli, ko izmanto šo instrukciju izpildei. Katrs proteīns jūsu ķermenī ir gara šo 20 aminoskābju ķēde, kas salocīta noteiktā formā, lai veiktu uzdevumu — piemēram, pārnēsātu skābekli asinīs vai sagremotu pusdienas.
Ik pēc trim DNS burtiem (ko sauc par kodonu) darbojas kā komanda "ievietot šeit aminoskābi X". Tā kā ir 64 iespējamās DNS burtu kombinācijas, bet tikai 20 aminoskābes, sistēmai ir liela dublēšanās. Tas ir mazliet līdzīgi kā rokasgrāmatā būtu pieci dažādi veidi, kā pateikt vārdu "zils". Miljardiem gadu dzīvība ir vienkārši sadzīvojusi ar šo neefektivitāti.
Vienkāršiem vārdiem sakot, pētnieki tagad iet cauri šai rokasgrāmatai un dzēš vienu no vārdiem. Viņi paņem konkrētu aminoskābi — piemēram, serīnu vai leicīnu — un pārveido šūnas mehānismu tā, lai tas vairs neatpazītu šo konkrēto kluci. Pēc tam viņi aizstāj katru šī "izdzēstā" kluča gadījumu ar līdzīgu no atlikušajām 19. Būtībā viņi racionalizē dzīvības avota kodu, lai tas darbotos uz ierobežotāka aparatūras komplekta.
Kāpēc pielikt milzīgas pūles, lai pārrakstītu genomu, izmantojot mazāk detaļu? Atbilde slēpjas drošībā un industriālajā noturībā. Pašlaik mūsu svarīgākās zāles — piemēram, insulīns un noteiktas vēža ārstēšanas metodes — tiek ražotas milzīgās baktēriju vai rauga tvertnēs. Šīs mikroskopiskās rūpnīcas ir ļoti efektīvas, taču tām ir milzīga ievainojamība: tās runā tajā pašā valodā, kurā pārējā pasaule.
Ja vīruss iekļūst tradicionālā bioreaktorā, tas var pārņemt baktērijas, jo gan vīruss, gan baktērijas izmanto tās pašas 20 aminoskābes. Vīruss izmanto baktēriju pašu "3D printerus", lai radītu vairāk sevis, iznīcinot partiju un izmaksājot uzņēmumiem miljoniem dolāru.
Samazinot kodu līdz 19 aminoskābēm, zinātnieki izveido to, ko viņi sauc par ģenētisko ugunsmūri. Organisms ar 19 aminoskābēm būtībā runā dialektā, ko neviens dabiskais vīruss nespēj saprast. Ja vīruss iekļūst "19 skābju" šūnā un pieprasa izmantot 20. kluci, lai izveidotu vīrusa proteīnu, šūna to vienkārši nespēj izdarīt. Instrukcijas kļūst par bezjēdzību. Tas rada stabilu, decentralizētu aizsardzības sistēmu, kas varētu padarīt dzīvību glābjošu zāļu ražošanu daudz lētāku un uzticamāku.
Vidusmēra lietotājam ideja par 19 aminoskābju baktēriju var šķist tāla akadēmiska nodarbe. Tomēr praktiski runājot, šī tehnoloģija ir pamats izturīgākai piegādes ķēdei farmācijas un materiālu rūpniecībā.
Apsveriet zāļu cenu svārstīgumu. Ievērojamu daļu bioloģisko zāļu izmaksu veido ārkārtējie pasākumi, kas tiek veikti, lai ražošanas vidi uzturētu sterilu un brīvu no vīrusiem. Ja mēs varam pāriet uz "pēc būtības drošiem" organismiem, kas pēc konstrukcijas ir imūni pret dabisko piesārņojumu, mēs mainām medicīnas ekonomiku. Mēs raugāmies uz nākotni, kurā dzīvības aparatūra ir mazāk trausla.
Turklāt šis pētījums paver durvis patiesi sintētiskiem materiāliem. Tiklīdz jums ir šūna, kas ignorē vienu no standarta 20 aminoskābēm, jūs varat "pārpiešķirt" šo tukšo vietu sintētiskai, cilvēka radītai aminoskābei. Tas ļauj mums izveidot proteīnus ar īpašībām, kas dabā nepastāv — iedomājieties šķiedras, kas ir tikpat stipras kā zirnekļa zīds, bet elastīgas kā gumija, vai enzīmus, kas var noārdīt plastmasu okeānā, paši nesadaloties.
Protams, ikreiz, kad mēs iejaucamies bioloģijas pamata loģikā, veselīga skepses deva ir noderīga. Sintētiskās bioloģijas kritiķi bieži norāda uz "neparedzētu seku" risku. Ja mēs radām organismu, kas ir imūns pret visiem zināmajiem vīrusiem, kas notiek, ja tas izkļūst no laboratorijas?
Interesanti, ka 19 aminoskābju pieeja patiesībā piedāvā iebūvētu drošības mehānismu. Šie inženierijas ceļā izveidotie organismi bieži ir izstrādāti kā "auksotrofi", kas nozīmē, ka tie ir atkarīgi no konkrētas sintētiskas ķīmiskas vielas, kas savvaļā neeksistē. Ja tie atstāj kontrolēto laboratorijas vai rūpnīcas vidi, tie vienkārši pārtrauc darboties. Atšķirībā no tradicionālajiem ĢMO, kas ir tikai nedaudz modificētas dabisko augu versijas, šie samazinātā koda organismi ir tik fundamentāli atšķirīgi, ka tie ir bioloģiski izolēti no pārējās planētas ekosistēmas.
Raugoties no tirgus puses, mēs redzam maiņu tajā, kur plūst riska kapitāls. Iepriekšējā desmitgade bija veltīta DNS "lasīšanai" (genomika) un DNS "rediģēšanai" (CRISPR). Nākamā desmitgade arvien vairāk būs veltīta pilnīgi jaunu sistēmu "rakstīšanai".
Vēsturiski smagā rūpniecība balstījās uz ķīmiju un siltumu, lai veidotu pasauli. Šodien mēs redzam bioloģiju kā mūsdienu ražošanas neredzamo mugurkaulu. Neatkarīgi no tā, vai tā ir reaktīvās degvielas brūvēšana no aļģēm vai ādas audzēšana laboratorijā, mērķis ir padarīt šos procesus tikpat prognozējamus un mērogojamus kā programmatūras atjauninājumu. Ģenētiskā koda sarežģītības samazināšana ir graujošs solis ceļā uz to, lai padarītu bioloģiju par īstu inženierzinātņu disciplīnu, nevis nejaušu veiksmju virkni.
| Funkcija | Standarta bioloģija (20 aminoskābes) | Racionalizēta bioloģija (19 aminoskābes) |
|---|---|---|
| Vīrusu rezistence | Neaizsargāta pret dabiskajiem vīrusiem | Dabiski imūna pret lielāko daļu vīrusu |
| Drošība/Ierobežošana | Bieži var krustoties ar savvaļas sugām | Bioloģiski izolēta/Ģenētiskais ugunsmūris |
| Industriālā izmantošana | Augstas sterilizācijas izmaksas | Potenciāls "atvērtā tipa" bioprocesiem |
| Materiālu daudzveidība | Ierobežota ar dabiskiem proteīniem | Var iekļaut sintētiskus būvelementus |
| Sarežģītība | Augsta (evolūcijas "spageti kods") | Samazināta (izstrādāta efektivitātei) |
Galu galā šis pētījums liecina, ka dabas ierobežojumi nav tik stingri, kā mēs kādreiz domājām. Noņemot vienu mazu ģenētiskās mīklas gabaliņu, mēs ne tikai padarām dzīvību vienkāršāku; mēs padarām to kontrolējamāku, izturīgāku un noderīgāku mūsdienu industriālajai pasaulei. Kā patērētājs jūs, iespējams, nekad neredzēsiet 19 aminoskābju šūnu, taču jūs gandrīz noteikti izmantosiet produktus, ko tās rada. Ir pienācis laiks mainīt mūsu perspektīvu: dažreiz, lai virzītos uz priekšu, mums ir jāatstāj daļa pagātnes aiz muguras.
Avoti:



Mūsu end-to-end šifrētais e-pasta un mākoņdatu glabāšanas risinājums nodrošina visefektīvākos līdzekļus drošai datu apmaiņai, garantējot jūsu datu drošību un konfidencialitāti.
/ Izveidot bezmaksas kontu